RIP 实验方案1. 细胞收集1.1.培养细胞至一定密度,按照实验要求进行处理。1.2.如果需要进行交联步骤,则需要优化固定时间。查看我们ChIP 实验方案中的交联部分。1.3.通过由于miRNA形成RISC复合体结合的时候,是被AGO蛋白包裹的,主要是AGO2。也就是说,拉下AGO2蛋白,就能拉下结合在上面的miRNA,这样RISC结合的LncRNA以及mRNA也会被拉下来。这就是AGO2-RIP,也就是通过拉m
≥▂≤ Ago2-RIP,Ago2是一种与microRNA结合后调控Mrna翻译的蛋白,本实验利用Ago2-抗体钓取与ago2蛋白结合的RNA,产物进行Q-PCR检测,表明Lnc-MD1与Ago2结合。我公司在实验体系中设置阳性及阴1)利用AGO2-RIP-PCR(云序提供该服务)证明,AGO2能够富集circINTS4和miR-146b(图B);2)通过双荧光素酶报告实验证明circINTS4与miR-146b存在结合位点(图C、D);3)作者通过circINTS4探针
01 RIP实验原理RIP技术(RNABinding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络的有力工具。运用针对目标蛋白实验技术流程一般包括:细胞收集裂解、抗体磁珠孵育、蛋白孵育、洗脱、RNA纯化、逆转录QPCR验证或测序分析。实验分组input AGO2 U1C IgG 蛋白总裂解液+ + + + 目的抗体+ 阳性抗体+
˙ω˙ ago2 rip实验原理go2 rip实验原理RIP 实验基本原理:1. 用抗体或表位标记物捕获细胞核内或细胞质中内源性的RNA结合蛋白。2. 防止非特异性的RNA的结合。3. 免疫沉淀把RNA结为了研究FOXP4-AS1在PCa中的调控模式,通过FISH实验确认了FOXP4-AS1主要位于细胞质,因此,FOXP4-AS1应该是转录后调控。ceRNA是lncRNA的常见转录后调控模式,FOXP4-AS1是否具有miRNA结
于是,作者借助AGO2 RIP实验(云序生物提供此项服务)在实验组中拉取与AGO2蛋白直接结合的miRNA,通过miRNA 定量PCR,证实以上三个miRNA能够直接与AGO2蛋白结合,参与了海绵机制,并且也证图2-1 RIP 实验拓扑Internet 1、根据实验拓扑,对路由器各接口配置IP 地址,配置清单如下。注:每个IP 地址的第二字节修改为自己的学号后两位位,R1 的loopba