并且CDR1as是与IGF2BP3结合最多的富集的circRNA,这与之前RIP-PCR结果一致，表明了circRIP的可靠性。作者还比较了IP样本中IGF2BP3富集和非富集circRNA的reads计数(reads count),发现I蛋⽩质与核酸相互作⽤：RIP-Seq, ChIP-Seq, CLIP-Seq 1 ChIP-Seq技术1.1 概念染⾊质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也称结合位点分析法，研究体内
MeRIP-seq结果显示：胚胎期骨骼肌发育六个不同阶段的m6A修饰呈现高度的动态变化，且大多数受影响的基因在与骨骼肌发育相关的通路中富集。IGF2BP1 RIP-seq证实了胰岛素样生长因子2 mRN集有TCGA数据库中699名患者的转录组数据，以及CGGA中包含325个样本的RNA-seq数据(ID是mRNAseq_325);在生存分析时，用到了138名GBM患者的临床信息，其中54名为复发性和继发性；此
￣□￣｜｜ RIP-seq 结果展示与参考基因组比对严格的比对率、比对质量。利用软件，将读段与参考序列进行比对。peak峰检出反应peak的分布及序列情况利用软件完成峰检分析(peak callin作者进一步利用RIP-seq(云序生物提供)快速明确哪些mRNA能够和蛋白AET1结合，分析结果显示AET1的功能丧失可以通过tRNA的表达分布的失衡从而影响蛋白的合成。比较有趣的是，热图提示高
本次主要是分析ChIP-Seq的高通量测序结果，因此，先介绍什么是ChIP-Seq. 所谓的ChIP-Seq其实就是把ChIP实验做完得到的DNA不仅仅用来跑胶，还送去高通量测序了。重点在于ChIP,也就是染色体免疫共沉淀(RIP(RNA Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，是了解转录后调控网络的有力工具。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来，然后经过分离纯化就可以对
tcga正常血液样本中pdl1与brca1和nbs1的表达量相关性没找到原数据但重复出了结果ps目前为止我还是没能找到tcga中bloodderivednormal样本的rnaseq数据当时文中fig4的测序数据IP与Input比较可判断IP效率(是否有效富集),IgG做阴性对照可判断IP的特异性(是否为特异性富集)。经过这些对照层层把关，RIP实验、RIP-seq的结果才能更有保障、更加高质、可靠。WB质检
