pAKTth308、p70S6K上调和PTEN下调)发生显著改变,共25个蛋白表达上调,18个蛋白表达下调;通路富集分析显示,多种恶性肿瘤相关信号通路发生改变,包括PI3K、mTOR和AMPK以及细胞凋亡诱导。除了经典的信号通路和代谢通路富集,IPA还可以挖掘关键上游调控因子、下游影响疾病和生物学功能、多组学数据整合分析、时间序列比较分析、公共组学数据挖掘等分析。 | / IPA
Dapars2 分析可变聚腺苷酸化(APA3UTR变懒了,不想写记录了!APA广泛存在于真核生物中。APA)是真核细胞mRNA成熟过程中加工和修饰前体mRNA 3’端的一种方式,如何用Shell脚本编译生成归IPA(Ingenuity Pathway Analysis,通路分析软件)是一款基于云计算的图形化界面生物信息学软件,能够从生物学通路角度将组学数据进行分析、整合和理解,适用于转录组学、蛋白质组学、代
使用IPA疾病和功能分析,能将癌症中低细胞凋亡,高存活高细胞运动的标记都找出来。像免疫系统中观测到的不正常的分子,可以作为治疗研究的靶点。经典通路的分析同样显示出癌症中一些吉凯基因IPA分析主要包含5个模块一、经典通路分析( 寻找目的基因调控以后显著影响的信号通路) 二、上游调控分析(寻找差异基因上游关键调控因子) 三、疾病和功能分析(寻找差异基
9、IPA通路分析相关网页教程IPA FAQ: http://ingenuity.force/ipa/IPATutorials# ###有各种相关教程和帮助文件。IPA 分析结果展示:http://lucidusbIPA是一个一体化并以网络为基础的应用软件,通过它,您能够分析、整合、理解来自于基因表达,microRNA,SNP微阵列的数据,代谢物组学和蛋白质组学的实验数据,和一些